安徽医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等多功能于一体的非营利性、三级甲等现代化综合性教学医院。医院于2008年开诊，2013年率先在安徽省按照原卫生部部颁标准通过国家三级医院等级评审。2017年初，医院以高分通过JCI（Joint Commission International, 医疗机构评审联合委员会国际部）评审，成为安徽省首家获得JCI认证、全国第十家以学术型医学中心医院通过JCI评审的大型公立医院。

近年来，医院先后荣获了“全国卫生先进单位”、“全国百姓放心示范医院”、“全国创先争优先进基层党组织”、“全国医院文化建设先进单位”和“全国城市医院思想政治工作先进单位”称号。同时，因在医疗服务创新方面做出突出成绩，被国家卫计委评为“改善医疗服务创新医院”，成为安徽省唯一获此殊荣的省级三甲医院。

医院位于合肥市经济技术开发区、高新技术开发区和政务文化新区交汇处，总建筑面积281668平方米，目前开放床位2200余张。院内以连廊及科学的流线设计将医用、人流、物流科学分开，配以现代医用净化空调、全面集成数字化信息系统、完善的生活休闲服务设施和大面积休闲绿地，共同构筑了一座花园式、人性化的大型医院，2018年被评为首届中国最美医院。

医院现有高级职称人才280余人，博士121人，硕士632人，博士生导师28人，享受国务院特殊津贴2人，省政府特殊津贴3人，医院现有国家级人才3人、省级人才37人，其中国家卫生计生突贡中青年专家1人，省学术技术带头人及后备人选14人，“江淮名医”7人，皖江学者特聘教授1人，青年皖江学者2人，省卫生系统青年领军人才9人，省级以上学术团体主委及副主委118人。

医院学科齐全，综合诊疗水平高，目前共开设了30余个临床科室和10余个医技科室，有肿瘤科、麻醉与围术期医学科、呼吸与危重症医学科、骨科、肾内科、血液内科、儿科7个省级临床重点专科。医院为挖掘内在潜力，重点培育发展，着力实施“建名科、树名医”战略，加大对学科建设的投入和扶持力度，2015年确定麻醉与围术期医学科、肾脏内科、康复运动医学科、骨科、泌尿外科、检验科、眼科和放射科8个院级重点发展专科。医院以这些重点学科为依托，整合资源，协调发展，形成具有我院特色的学科建设方向。